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Neue Merkmale von InfluSim Version 2.1
Veränderungen von Version 2.0 beta auf Version 2.1
Benutzeroberfläche
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InfluSim ist jetzt in verschiedenen Sprachen verfügbar.
Es erkennt automatisch die bei Windows eingestellte Sprachregion und startet dann mit der entsprechenden Sprachversion (wenn die eingestellte Sprachversion noch nicht existiert, wird automatisch die englische Version gestartet).
Bisher sind folgende Sprachen verfügbar:
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deutsch (-nl de)
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englisch (-nl en
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französisch (-nl fr)
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italienisch (-nl it)
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japanisch (-nl ja)
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koreanisch (-nl ko)
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portugiesisch (-nl pt)
Weitere Sprachen werden wir gerne hinzufügen (in Vorbereitung sind griechisch und spanisch), soweit sich sachverständige muttersprachliche Experten zu einer Übersetzung der Parameterseiten bereit erklären.
Um InfluSim auf Ihrem Computer in einer dieser Sprachen zu starten, muss entweder in Windows die entsprechende Ländereinstellung getätigt sein, oder Sie müssen InfluSim mit der angegebenen Option "-nl xx" starten.
Hierfür bietet Windows verschiedene Möglichkeiten.
Sie können z.B. ein DOS-Fenster öffnen, durch "cd Desktop\InfluSim" in das Verzeichnis wechseln, in dem Sie InfluSim abgelegt haben, und dann "influsim.exe -nl fr" (ohne die Anführungszeichen) eintippen, um die französische Version zu erhalten.
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Die Parametereinstellung in InfluSim 2.1 ist jetzt in verschiedene Sektionen aufgeteilt, die durch Reiter unterhalb der Schieberegler angewählt werden können.
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InfluSim 2.1 läuft jetzt auch, ohne ein spezielles Verzeichnis anzulegen (kann von einer CD aus gestartet werden)
Inhaltliche Veränderungen
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Einbau eines Krankenhauses mit Krankenpflegepersonal, das in engen Kontakt mit den Erkrankten kommt.
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Propyhlaktische Behandlung mit antiviralen Medikamenten für das Krankenpflegepersonal.
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Der Betreuungsfaktor von erkrankten Kindern und von gesunden Kindern während der Schulschließung wird jetzt anders interpretiert.
In der vorigen Version wurden die Kontakte zwischen Kindern und Erwachsenen mit dem angegebenen Faktor multipliziert.
Da dies zu schweren Missverständnissen führte, haben wir die Interpretation dieser Parameter geändert:
Der Benutzer muss jetzt angeben, welcher Anteil der Kontakte, die normalerweise in der Schule stattgefunden hätte (jetzt aber durch Schulschließung oder Erkrankung des Kinders verhindert sind), auf Erwachsene umgelenkt wird.
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Schulen und Kindergärten können jetzt unabhängig voneinander geschlossen und geöffnet werden.
Jede der drei Altersklassen der Kinder hat hierfür einen separaten Schieberegler.
Veränderungen von Version 1.3 auf Version 2.0 beta
Benutzeroberfläche
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InfluSim 2.0 beta kommt mit einer völlig überarbeiteten neuen Benutzeroberfläche.
Diese Änderung war nötig, um die geplante weitere Entwicklung von InfluSim zu ermöglichen.
Wir haben bei dieser Umstrukturierung aber dennoch versucht, die Benutzeroberfläche zunächst weitgehend so zu gestalten, dass der Benutzer der früheren Versionen sich noch gut zurechtfinden kann.
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Es steht jetzt online eine ausführliche Hilfefunktion zur Verfügung, die aber zunächst nur auf Englisch verfügbar ist.
Eine Internationalisierung des Programms InfluSim mit deutscher Oberfläche und deutschem Benutzerhandbuch soll in Kürze folgen.
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Die wichtigsten Merkmale der neuen Benutzeroberfläche sind in der (englischen) Hilfefunktion näher beschrieben.
Inhaltliche Veränderungen
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InfluSim 2.0 beta läuft nicht mehr unter JAVA 1.4.
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InfluSim 2.0 beta basiert nicht mehr wie früher auf drei Altersklassen sondern auf sechs Altersklassen.
Damit ist auch die Anzahl von Differentialgleichungen von etwa 500 auf 1000 angestiegen.
Die Kontaktmatrix wurde entsprechend von drei mal drei auf sechs mal sechs Einträge erweitert (Wallinga et al. 2006 (Am J Epidemiol, in press).
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Bei einer Kindergärten- und Schulschließung werden die Kontakte zwischen Kindern und Erwachsenen jetzt anders umverteilt:
Statt einen Anteil der durch Schulschließung eingesparten Kontakte auf die Erwachsenen "umzulegen", werden jetzt die Kontakte zwischen Kindern und Erwachsenen mit einer Konstanten multiplizert.
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Die Schließung von Kindergärten und Schulen verhindert nur Kontakte zwischen Kindern in der gleichen Altersklasse, aber nicht die Kontakte zwischen Kindern unterschiedlicher Altersklassen (diese Unterscheidung war in früheren Versionen von InfluSim nicht möglich, da es dort bisher nur eine Altersklasse für Kinder gab).
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Bei schwer erkrankten Kindern entfallen die Kindergärten- und Schulkontakte innerhalb der Altersklasse auch dann wenn die Kindergärten und Schulen eigentlich geöffnet sind.
Dafür erhöhen sich die Kontakte zu Erwachsenen um einen bestimmten Faktor.
Veränderungen von Version 1.2 auf Version 1.3
Fehlerbehebung
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In der vorigen Version war in den ersten Sekunden nach Simulationsstart auch dann noch eine antivirale Behandlung möglich, wenn die antiviralen Ressourcen eingentlich auf Null gesetzt waren.
Dieser Fehler führte zu geringfügigen Änderungen im Gesamtsimulationslauf (hinter dem Komma), wenn antivirale Behandlung eingeschaltet wurde.
Sonstige Veränderungen
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Die Schieberegler für die teilweise Isolation von moderat Erkrankten, schwer Erkranken zu Hause und hospitalisierten Patienten wurden von der Sektion "Social distancing" in die Sektion "Contagiousness" verschoben.
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Beginn und Ende der teilweisen Isolation von Fällen kann jetzt ebenfalls mit Schiebereglern festgelegt werden.
Um die Kompatibilität zu älteren Versionen zu erhalten, wurden die Voreinstellung dieser Schieberegler auf einen maximal großen Zeitraum (0-500 Tage) gesetzt.
Veränderungen von Version 1.1 auf Version 1.2
Fehlerbehebung
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Auf der Eingabeseite "Social distancing" wurden folgende Voreinstellungen geändert:
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Der Parameter "Child-child contacts at school" wird jetzt auf 50% voreingestellt.
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Der in der gleichen Sektion befindliche Schieberegler "End on day" wird dagegen auf 0 gesetzt.
Durch die früheren Einstellungen wurden die Kontakte bettlägriger Kinder nicht adäquat auf Erwachsene umverteilt.
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Der als "hospitalisierte Fälle" angezeigte Wert in den früheren Versionen war fälschlicherweise auf die unbehandelten hospitalisierten Fälle beschränkt (es handelte sich hierbei nur um ein Anzeigeproblem, das keine Auswirkungen auf die Dynamik der Infektionsausbreitung hatte).
Für die Standardparameter bedeutet das, dass die korrigierte Hospitalisierungszahl höher liegt als in den vorigen Versionen angegeben wurde, wenn Patienten behandelt werden.
Sonstige Veränderungen
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Die Skalierung der vertikalen Achse verändert sich in Version 1.2 nicht mehr, wenn Parameterwerte geändert werden.
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Veränderungen von Version 1.0 auf Version 1.1
Inhaltlich wichtige Veränderungen
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Die Infektiosität kann jetzt über den Krankheitsverlauf hin exponentiell abnehmen.
Der voreingestellte Wert sieht vor, dass 90% der Infektiosität auf die erste Krankheitshälfte konzentriert sind.
Durch die Konzentration der Infektiosität auf die initiale Erkrankungsphase schreitet die Epidemie viel schneller fort.
InfluSim 1.1: Infektiosität jetzt auf die erste Erkrankungshälfte konzentriert
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Durch Absage von Massenveranstaltungen werden nur noch Kontakte zu infizierten Erwachsenen vermieden, die gesund genug sind, an solchen Veranstaltungen teilzunehmen (also nicht zu schwerkranken oder hospitalisierten Fällen sondern nur noch zu symptomlosen oder moderat erkrankten Fällen).
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Durch die Schließung von Kindergärten und Schulen werden nur noch Kontakte zu infizierten Kindern vermieden, die gesund genug sind, den Kindergarten oder die Schule zu besuchen (also nicht zu schwerkranken oder hospitalisierten Fällen sondern nur noch zu symptomlosen oder moderat erkrankten Fällen).
InfluSim 1.1: Kontakte, die Kinder in der Schule haben
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Ein neuer Schieberegler legt fest, welcher Anteil der Kontakte, die gesunde Kinder mit anderen Kindern haben, in der Schule stattfindet (dieser Schieberegler ersetzt den Schieberegler, mit dem man einstellte, welcher Anteil der Kontakte unter Kindern durch die Schließung von Kindergärten und Schulen vermieden werden kann).
Bei Kindern, die schwer erkranken, wird dieser Anteil von den Kind-Kind-Kontakten abgezogen und in Kind-Erwachsenen-Kontakte umgewandelt (häusliche Pflege).
Während einer Kindergärten- und Schulschließung werden auch für gesunde und leicht erkrankte Kinder diese Kind-Kind-Kontakte unterbunden und der über den Umverteilungs-Schieberegler eingestellte Anteil dieser Kontakte wird in Kind-Erwachsenen-Kontakte umgewandelt.
In extremen Fällen führt eine solche Umverteilung zu einer erhöhten Basisreproduktionszahl, was wiederum eine erhöhte Übertragung mit sich bringt.
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Der Schieberegler "Reduction of case fatality by [%]" wurde in der Sektion "Treatment effects" entfernt, da bestimmte Einstellungen zu dem unerwünschten Effekt führen konnten, dass ein höherer Prozentsatz der hospitalisierten behandelten Fälle als der hospitalisierten unbehandelten Fälle stirbt.
In der neuen Version von InfluSim wird davon ausgegangen, dass - ungeachtet der antiviralen Behandlung - täglich der gleiche Anteil hospitalisierter Fälle stirbt.
Der Schieberegler "Reduction of hospitalisation by [%]" impliziert also bereits eine Reduktion der Sterblichkeit von behandelten Fällen.
Die Verkürzung der Erkrankungszeit durch die Behandlung impliziert ebenfalls, dass unter den behandelten hospitalisierten Fällen weniger sterben als unter den unbehandelten.
Sonstige Veränderungen
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Die Infektionsparameter befinden sich jetzt auf einer eigenen Seite ("Contagiousness") und sind nicht mehr mit den klinischen Parametern ("Disease") vermischt.
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Die Infektionseinschleppung erfolgt nicht mehr länger durch die Infektion eines Erwachsener der Nicht-Risikogruppe, sondern wird über alle Gruppen verteilt (für Einzelheiten, siehe mathematische Beschreibung des Programms).
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Die Infizierten werden auf Null gesetzt, sobald die Summe aller Infizierten in der Simulation weniger als 0,5 beträgt (vorher war dies der Fall, wenn weniger als 0,5 pro 100.000 Personen infiziert waren).
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Die Eingabefelder für die Anzahl Personen in den drei Altersgruppen akzeptieren keine kleineren Werte mehr als 1 und keine größeren Werte mehr als 1 Million.
Dadurch wird an dieser Stelle einerseits die Division durch Null verhindert, andererseits sollen keine unrealistisch große Populationen mehr eingegeben werden können (in großen Populationen muss man die räumliche Ausbreitung mit berücksichtigen).
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Die Eingabefelder für Prozentsätze (Risikogruppen und Hospitalisierungen) akzeptieren nur noch eingegebene Werte im Bereich von 0 bis 100.
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Die Eingabefelder für die Dauer der Latenz, der infektiösen Periode und der Rekonvaleszenz akzeptieren keine kleineren Werte mehr als 0,25 Tage (kleinere Werte können die Simulationszeit stark erhöhen oder zu Division durch Null führen).
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Die Eingabefelder für die Kontaktmatrix akzeptieren keine Werte mehr, die kleiner sind als 0,25 (dadurch wird an dieser Stelle die Division durch Null verhindert).
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Die Grenzen der Schieberegler für den Zeitpunkt des Arztbesuches (in Stunden) und für das therapeutische Fenster wurden auf 1-101 gesetzt (statt 0-100; dadurch wird an dieser Stelle die Division durch Null verhindert).
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Der Schieberegler für R0 wurde auf den Bereich 1-5 (statt vorher: 0-10) eingestellt.
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Die Startwerte für den hospitalisierten Anteil der schwer Erkrankten wurden neu berechnet und leicht modifiziert.
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Im Quelltext können jetzt statt zwei Stadien beliebig viele Stadien für die prodromale Periode eintestellt werden.
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