Das Institut verwahrt Nachlassbestände folgender Persönlichkeiten:

Otto Scherzer (1821–1886)
von 1860 bis 1877 Universitätsmusikdirektor in Tübingen

Christian Fink (1831–1911)
Komponist, langjährig Musiklehrer am Lehrerseminar sowie Musikdirektor an der Stadtkirche St. Dionys Esslingen am Neckar

Fritz Volbach (1861–1940)
von 1907 bis 1918 Universitätsmusikdirektor und außerordentlicher Professor in Tübingen

Karl Hasse (1883–1960)
von 1919 bis 1935 Universitätsmusikdirektor und außerordentlicher Professor in Tübingen

Georg von Dadelsen (1918–2007)
von 1971 bis 1983 Ordinarius am Musikwissenschaftlichen Institut

Arnold Feil (1925–2019)
von 1979 bis 1988 Professor für Musikwissenschaft in Tübingen

Henning Siedentopf (1937–2022)
Musikwissenschaftler und Komponist in Tübingen